Sarbecovirus anteriorment desconegut es va revelar als ratpenats al Regne Unit

Sarbecovirus anteriorment desconegut es va revelar als ratpenats al Regne Unit
Sarbecovirus anteriorment desconegut es va revelar als ratpenats al Regne Unit
Anonim

Els científics han descobert el nou sarbecovirus RhGB01 després d’examinar només 53 mostres fecals de ratpenats de ferradura, ampliant el rang geogràfic i d’espècies de coronavirus com el SARS-CoV i el SARS-CoV-2. Presumiblement, es trobaran a tota la gamma de Rhinolophidae, des d’Austràlia i el Japó fins a Europa i Àfrica.

Més d’un any després, encara es desconeix la font del brot actual de coronavirus, malgrat milers d’estudis, informes, investigacions de l’OMS i molt més. Els ratpenats de ferradura (Rhinolophus) es consideren hostes naturals tant del SARS-CoV (síndrome respiratòria aguda greu que va sorgir el 2002) com del nostre SARS-CoV-2, però no s’ha identificat cap portador intermedi que transmetés el virus als humans.

La gamma de ratpenats cobreix la major part del Vell Món, però la major part de les mostres es van prendre prèviament a l’est i el sud-est asiàtic: s’hi van trobar prop de 50 coronavirus relacionats amb el SARS en deu espècies de ratpenats, 48 dels quals pertanyen a nou diferents ratpenats de ferradura. L’anàlisi filogenètica dels nous sarbecovirus, és a dir, dels coronavirus associats al SARS, en forma de ferradura a la Xina va demostrar que estan més estretament relacionats amb el SARS-CoV i el SARS-CoV-2.

Els científics de la Universitat d'East Anglia van decidir complementar aquestes dades. Els autors de l’estudi, publicat ahir a Scientific Reports, van recollir femtes de dotzenes de petits animals amb forma de ferradura a Somerset, Monmouthshire i Gal·les els mesos d’agost i setembre de 2020. Els animals van ser capturats mitjançant trampes o xarxes situades a prop de les cases i als boscos.

Les femtes es van col·locar en tubs estèrils individuals que contenien una solució de RNAlater per a l'estabilització de l'ARN, es van refredar i es van emmagatzemar congelades abans de l'anàlisi. Els científics van realitzar llavors una seqüenciació del genoma, que va identificar un virus desconegut fins ara en una de les 53 mostres. Va rebre el nom de RhGB01. El virus conté 10 gens codificants, mentre que SARS-CoV i SARS-CoV-2 - 11 gens codificadors amb la inclusió de la proteïna ORF8.

“La filogènesi de les seqüències de proteïnes i nucleòtids d’espiga ha demostrat que RhGB01 es combina en un clade monofilètic amb BM48-31 / BGR / 2008, el sarbekovirus de ratpenat de ferradura Blasius (Rhinolophus blasii), descobert el 2008 a Bulgària. RhGB01 es diferencia dels clats que contenen els beta-coronavirus humans patògens SARS-CoV i SARS-CoV-2, però es correlaciona més estretament amb el coronavirus associat a la síndrome respiratòria aguda greu , escriuen els científics.

El principal receptor per a la penetració de SARS-CoV i SARS-CoV-2 en el cos continua sent l’enzim ACE2, aquesta oportunitat l’ofereix el motiu d’unió al receptor (RBM) dins del domini d’unió al receptor (RBD) del Proteïna S: forma l’embolcall del virus. El nou RhGB01 comparteix un 68% i un 67% d’identitat d’aminoàcids amb RBD SARS-CoV i SARS-CoV-2, respectivament, però només un 43% i un 48% similars a ells en RBM. Per a la comparació: els virus més propers associats al SARS-CoV-2, als ratpenats i als pangolins tenen una coincidència del 89% i del 86% amb el SARS-CoV-2 de RBD i el 75%, el 77% amb el SARS-CoV. A més, RhGB01 mostra poca similitud de RBM amb el virus de la síndrome respiratòria de l'Orient Mitjà (MERS). Tanmateix, no té cap lloc de trencament de furina addicional a la unió de proteïnes S1 i S2, que és específic per al SARS-CoV-2.

“El baix nivell de similitud, manca de residus de contacte i diferències estructurals en comparació amb el domini d’unió al receptor de SARS-CoV i SARS-CoV-2, indica molt probablement la manca de capacitat per unir-se a ACE2. Per tant, és probable que RhGB01 no sigui zoonòtic si no està mutat. Però es requereixen assajos in vitro per confirmar experimentalment la manca d’unió a ACE2 o altres receptors de les cèl·lules humanes i per determinar la capacitat d’unió a altres receptors ACE2 de mamífers”, van assenyalar els autors de l’estudi.

Tot i que sembla que el RhGB01 existeix des de fa milers d’anys, els científics creuen que val la pena reforçar la vigilància dels coronavirus en ratpenats de ferradura de tota la seva àrea de distribució, així com d’altres espècies de ratpenats. Al cap i a la fi, tant el SARS-CoV com el SARS-CoV-2, probablement, van evolucionar com a resultat de la mutació, la recombinació homòloga (intercanvi de seqüències de nucleòtids entre dos cromosomes similars o idèntics) i el "pas" per almenys un hoste intermedi.

És a dir, el virus predecessor de l’hoste natural va rebre una adaptació genètica, que va permetre infectar amb èxit les persones i transmetre-les entre nosaltres. I on hi ha una possibilitat de recombinació homòloga dels sarbecovirus mitjançant la coinfecció, hi ha el risc de noves zoonosis.

“Qualsevol ratpenat que porti un virus semblant al SARS pot convertir-se en un calder per a mutacions. I si un ratpenat amb RhGB01 s’infecta amb SARS-CoV-2, hi ha el risc que aquests virus s’hibridin i aparegui un de nou, que ja sigui capaç d’infectar humans”, van concloure els investigadors.

Recomanat: